中國研究:蝴蝶蘭基因數(shù)目與人類相似(圖)
胼胝兜蘭是蘭科兜蘭屬植物中的一個品種。兜蘭屬植物與大熊貓同列為國家一級重點保護,故有“植物大熊貓”之稱。
大根槽舌蘭是該計劃首先進行基因表達的轉(zhuǎn)錄組測序和分析的品種之一。
小蘭嶼蝴蝶蘭基因數(shù)目與人類相似
中國科學(xué)家近日宣布完成蘭花基因組框架圖擬揭示蘭花的進化歷史和奧秘
歷經(jīng)近4個月的研究,研究蘭花生存進化奧秘的“蘭花基因組計劃”終于取得里程碑式的重大研究成果。昨日,該計劃組的科學(xué)家們在深圳宣布,他們已經(jīng)完成蘭花基因框架圖,其研究對象――小蘭嶼蝴蝶蘭基因組序列框架圖的測序工作已經(jīng)完成,另外11種代表性蘭科植物的轉(zhuǎn)錄組測序也接近尾聲。此計劃協(xié)作組專家表示,這項研究結(jié)果不僅會揭示蘭花的進化歷史和奧秘,為后續(xù)蘭花功能和進化基因組學(xué)研究打下堅實的基礎(chǔ),而且為如何保護我國寶貴蘭花種質(zhì)資源、加速蘭花新品種創(chuàng)新作出了重大貢獻。
“蘭花基因組計劃”的科學(xué)家們同時表示,他們下一步將以框架圖的組裝分析為基礎(chǔ),繼續(xù)推進小蘭嶼蝴蝶蘭的基因組圖譜的精細化水平,以構(gòu)建蘭科植物進化的研究框架和體系。
“蘭花基因組計劃”7月啟動
據(jù)華大基因研究院的張勇博士介紹,蘭科植物(蘭花)是植物界最大和進化程度最高的家族之一,是生物多樣性和進化研究以及生物保護的旗艦和理想模式類群,具有極高的科研、生態(tài)、觀賞和藥用價值,今天仍然是研究生命與進化的理想模式植物。
同時,蘭花又是世界性的瀕危物種,也是國際貿(mào)易公約保護物種的重中之重,因其資源珍貴而被喻為“植物界大熊貓”。然而,對蘭花基因組缺乏了解已成為當(dāng)今蘭花研究及保護利用的瓶頸。
今年7月20日,由深圳市蘭科植物保護研究中心、清華大學(xué)深圳研究生院、深圳華大基因研究院發(fā)起,中國科學(xué)院植物研究所、臺灣成功大學(xué)等機構(gòu)共同組成“蘭花基因組計劃聯(lián)合體”,率先對小蘭嶼蝴蝶蘭進行全基因組測序和生物信息分析;同時,還對杏黃兜蘭、大根槽舌蘭、蜜蜂眉蘭等11種代表性蘭科植物進行基因表達的轉(zhuǎn)錄組測序和分析,為揭示蘭科植物遺傳變異和分子進化特點提供科學(xué)依據(jù)。
蘭花基因數(shù)目與人類相似
昨日,華大基因研究院召開新聞發(fā)布會宣布,經(jīng)過蘭花基因組計劃協(xié)作組的聯(lián)合攻關(guān),科學(xué)家們已經(jīng)完成小蘭嶼蝴蝶蘭基因組序列框架圖的測序工作,目前正在進入數(shù)據(jù)后續(xù)組裝分析階段。
據(jù)深圳市蘭科植物保護研究中心主任劉仲健教授介紹,“蘭花基因組計劃”的基因組測序研究結(jié)果揭示,小蘭嶼蝴蝶蘭基因組大小約12億個堿基對,GC含量約34.4%,基因數(shù)目約23000個?!斑@個基因數(shù)目與人類的極為接近?!眲⒅俳≌f。
據(jù)介紹,另外11種代表性蘭科植物的轉(zhuǎn)錄組測序也接近尾聲,其中9種蘭花的測序工作已經(jīng)完成,總數(shù)據(jù)量達到25Gb,拼裝出了長度大于2Kb轉(zhuǎn)錄本共12702條,其余兩種正在進行。
為保護蘭花提供科學(xué)依據(jù)
蘭花基因組計劃協(xié)作組的專家告訴記者,據(jù)介紹,目前被列入國際貿(mào)易公約(CITES)保護的瀕危野生動植物物種約有1500多種,其中蘭花就占到90%,而我國的蘭科植物種群數(shù)量也正在迅速減少,眾多珍稀種類陷入瀕危和滅絕境地。
“這項研究成果將為如何保護我國寶貴的蘭花種質(zhì)資源提供科學(xué)依據(jù),為下一步開發(fā)和利用蘭科植物基因資源寶庫提供重要的資源平臺,同時,對揭示蘭花的進化歷史和奧秘,對加速蘭花品種創(chuàng)新、提升治療藥效等重要性狀及蘭花相關(guān)產(chǎn)業(yè)鏈發(fā)展也將作出重大貢獻?!眲⒅俳”硎?。
將基因圖譜推進精細圖水平
該計劃組的科學(xué)家們昨日還在發(fā)布會上宣布,蘭花基因組框架圖完成后,他們下一步將以其組裝分析為基礎(chǔ),繼續(xù)把小蘭嶼蝴蝶蘭的基因組圖譜推進到精細圖的水平,進行基因注釋、比較基因組分析等。
同時,他們還將通過11個物種的轉(zhuǎn)錄組比較分析構(gòu)建蘭科植物進化的研究框架和體系,進一步深入進行蘭科植物的功能基因組學(xué)和進化基因組學(xué)研究,努力將蘭花打造成植物生命與進化研究嶄新的模式生物。
編輯:justin